In een interview voor het Franse tijdschrift TVmag, ter promotie van The Joneses, vertelt David Duchovny dat X-Files 3 op dit moment nog geen groen licht heeft maar wel wordt geschreven.
De eerste film, , werd goed ontvangen en bracht zo'n 189 miljoen dollar op in 1998. Het vervolg, , deed het tien jaar later beduidend minder. Duchovny denkt dat als het verhaal terugkeert naar de thema's van de originele serie de fans de film wel zullen waarderen. Het wantrouwen van de overheid, uitgebreide geïnstitutionaliseerde samenzweringen, buitenaardse wezens en al het andere bovennatuurlijke ligt dus in de verwachting. Nu productiemaatschappij Fox nog overtuigen.
X-Files -bedenker Chris Carter liet al eerder weten dat indien er een derde film zou komen deze zou terugkeren naar de mythologie van de serie waarbij de nadruk zou liggen op de invasie van aliens en kolonisatie van de aarde. Dit zou volgens de serie gebeuren op 22 december 2012, dat geeft de makers dus een harde deadline voor X-Files 3 .
